Cursuri de pregatire Fiji: Procesarea Imaginilor pentru Biotehnologie și Toxikologie

Introducere la Fiji și ImageJ

• Prezentare generală a lui Fiji și a aplicatiilor sale în cercetarea științifică
• Înțelegerea arhitecturii ImageJ și a plugin-urilor
• Instalarea și configurarea lui Fiji pentru o performanță optimă

Tehnici de Bază de Procesare a Imaginilor

• Acquisitia imaginilor și formatele de import
• Ajustarea contrastului, luminositàții și aplicarea filtrarilor
• Stacking-ul imaginilor și metode de proiecție

Analiza Avansată a Imaginilor

• Tehnici de segmentare: prăbușirea pragului și detectarea marginilor
• Numărarea obiectelor și analiza particulelor în probe histologice
• Măsurarea ariilor, perimetrului și altor caracteristici morfologice

Lucrul cu Probre Biologice

• Procesarea imaginilor de țesuturi histologice, celule de sânge și alge
• Dezconvoluția culorii și analiza țesuturilor colorate
• Analiza în timp real și urmărirea mișcării celulelor

Automatizarea și Personalizarea

• Crearea și executarea macro-urilor pentru sarcini repetitive
• Folosirea plugin-urilor Fiji pentru analize specializate
• Scripting de bază cu Limbajul Macro al ImageJ (IJM)

Gestionarea Datelor și Raportarea

• Exportarea rezultatelor și generarea rapoartelor
• Anotarea imaginilor și pregătirea datelor pentru publicare
• Practici de bună conduită pentru o analiză a imaginilor reproducibilă

Rezumat și Următorii Pași