Cursuri de pregatire Fiji: Prelucrarea imaginilor pentru Biotehnologie și toxicologie

Introducere în Fiji și ImageJ

• Prezentare generală a lui Fiji și aplicările sale în cercetarea științifică
• Comprezând arhitectura lui ImageJ și plugin-urile sale
• Instalarea și configurarea lui Fiji pentru o performanță optimală

Tehnici de bază de procesare a imaginilor

• Acquisiția imaginii și formatele de import
• Ajustarea contrastului, luminozității și aplicarea filtrelor
• Superpoziția și metode de proiecție a imaginilor

Avansuri în Image Analysis

• Tehnici de segmentare: pragare și detecția marginilor
• Numărarea obiectelor și analiza particulelor în probe histologice
• Măsurarea ariilor, perimetrului și altor caracteristici morfológice

Lucru cu probe Histológicale

• Procesarea imaginilor de tisssue histologică, celule sanguine și algae
• Deconvecționarea culorii și analiza tissu-urilor colorate
• Analiză cu timp real și urmărirea mișcărilor celulare

Automatizare și Personalizare

• Crearea și rularea macro-urilor pentru sarcini repetitive
• Utilizarea plugin-urilor lui Fiji pentru analize specializate
• Scriere de script-uri bazice cu limbajul Macro ImageJ (IJM)

Raportare și Rapoarte

• Exportarea rezultatelor și generarea rapoartelor
• Anotația imaginilor și pregătirea datelor pentru publicare
• Cele mai bune practici pentru analiza reproducibile a imaginilor

Rezumat și Următoarele Pași