Microbial Genomics Training in Chisinau

Genomica microbială și metagenomica combina tehnologiile de secvențare și analiza computatională pentru a descrie comunități microbieni, caracterizarea genomurilor și detectarea traiților funcționali precum rezistența la antimicrobiene.

Această instruire condusă de un instructor (online sau prezențial) este destinată cercetătorilor și bioinformaticienilor cu nivel de începător până la intermediar, care doresc să efectueze analize practice ale datelor de secvențare genomică microbială și metagenomică.

La sfârșitul acestei instruirii, participanții vor fi capabili să:

• Descrie fluxurile de lucru frecvente și formatele de fișiere cheie utilizate în genomica microbială.
• Efectueze controlul calității și preprocesarea citirilor NGS brute.
• Realizeze profilare taxonomică folosind abordările bazate pe markeri și k-mer.
• Asambleze și anoteze genomurile microbilor și plasmidele.
• Detecteze SNPs, construiască filogenei și interpreteze structura populației.
• Preveghească genele de rezistență la antimicrobiene și rezume profilele funcționale.
• Utilizeze fluxuri de lucru reproduceabile cu Conda, Docker și rapoarte bazate pe notebook-uri.

Formatul Cursului

• Prelegeri care introduc concepte și unelte (20%).
• Sesiuni practice hands-on folosind seturi de date exemplificative (60%).
• Discuții deschise și analize ghidate pentru ca participanții să poată aplica metodele la datele lor (20%).

Opțiuni de Personalizare a Cursului

• Pentru a solicita un atelier personalizat care să se concentreze pe metagenomica clinică, ambientală sau industrială, vă rugăm să ne contactați pentru a aranja.